O Museus do Mar resulta de um concurso público, realizado em 2008. O local onde hoje se situa o Museu foi de extrema importância para a definição de todo o projeto, por se situar no topo de uma das praças mais importantes, no centro da cidade. O orçamento disponível para a realização da obra definiu duas fases de construção de acordo com a disponibilidade financeira. O conceito de museu aqui explorado tira partido da transparência dos materiais de fachada, deixando perceber, do exterior, a grande nave interior, onde estão os conteúdos museológicos. O sistema construtivo considera a economia de meios nas tecnologias utilizadas, nomeadamente na escolha de materiais locais e na fácil e pouca manutenção do edifício. A formalidade do edifício aponta afinidades com a temática marítima, visível na estrutura das coberturas que refletem as formas da construção naval. O material principal utilizado é a madeira que desenha toda a estrutura do edifício. Este programa responde à perspetiva de salvaguardar o património da cultura pesqueira com uma canceção museológica que dá a conhecer os modos-de-vida das comunidades que recorrem a técnicas piscatórias em interação com o ambiente aquático e o território.